Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms