Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Habp4Q9JKS5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms