Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trem1Q9JKE2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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