Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra4Q9JJT2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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