Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zfhx4Q9JJN2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms