Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riox1Q9JJF3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms