Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Smad9Q9JIW5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smad9Q9JIW5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smad9Q9JIW5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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