Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnmb4Q9JIN6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnmb4Q9JIN6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms