Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LratQ9JI60 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LratQ9JI60 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms