Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EefsecQ9JHW4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms