Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn19Q9ET38 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn19Q9ET38 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn19Q9ET38 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn19Q9ET38 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cldn19Q9ET38 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cldn19Q9ET38 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cldn19Q9ET38 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cldn19Q9ET38 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cldn19Q9ET38 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cldn19Q9ET38 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cldn19Q9ET38 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Cldn19Q9ET38 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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