Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf13bQ9ET35 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms