Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkc1Q9ESX5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms