Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trim39Q9ESN2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim39Q9ESN2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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