Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
OtofQ9ESF1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtofQ9ESF1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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