Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc28a3Q9ERH8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms