Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tfcp2Q9ERA0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tfcp2Q9ERA0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tfcp2Q9ERA0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tfcp2Q9ERA0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tfcp2Q9ERA0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tfcp2Q9ERA0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tfcp2Q9ERA0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tfcp2Q9ERA0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tfcp2Q9ERA0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tfcp2Q9ERA0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tfcp2Q9ERA0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms