Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Capn12Q9ER56 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms