Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rapgef4Q9EQZ6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.8 ms