Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms