Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pak1ip1Q9DCE5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms