Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn3Q9DCB1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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