Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms