Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syde1Q9DBZ9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms