Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc97Q9DBT3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms