Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Med27Q9DB40 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Med27Q9DB40 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Med27Q9DB40 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Med27Q9DB40 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Med27Q9DB40 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Med27Q9DB40 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms