Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc89Q9DA73 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms