Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ift43Q9DA69 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ift43Q9DA69 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ift43Q9DA69 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ift43Q9DA69 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ift43Q9DA69 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ift43Q9DA69 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ift43Q9DA69 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ift43Q9DA69 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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