Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms