Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl4Q9D8E6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl4Q9D8E6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms