Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slx4ipQ9D7Y9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms