Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn22Q9D7U6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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