Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp4cQ9D7F7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp4cQ9D7F7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms