Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tube1Q9D6T1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms