Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc94Q9D6J3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms