Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Pfn4Q9D6I3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms