Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9bQ9D6E4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms