Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab11fip1Q9D620 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms