Protein–RNA interactions for Protein: Q9D552

Spata17, Spermatogenesis-associated protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata17Q9D552 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Spata17Q9D552 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Spata17Q9D552 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spata17Q9D552 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Spata17Q9D552 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Spata17Q9D552 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Spata17Q9D552 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Spata17Q9D552 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Spata17Q9D552 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Spata17Q9D552 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Spata17Q9D552 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spata17Q9D552 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Spata17Q9D552 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms