Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rabl3Q9D4V7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabl3Q9D4V7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms