Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms