Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syce1Q9D495 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syce1Q9D495 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms