Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cdh23-202ENSMUST00000105461 11096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms