Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx29Q9D3S3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms