Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms