Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Trappc6bQ9D289 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Trappc6bQ9D289 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Trappc6bQ9D289 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Trappc6bQ9D289 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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Trappc6bQ9D289 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc6bQ9D289 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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