Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Spns3Q9D232 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms