Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmbr1lQ9D1E5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms