Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ift27Q9D0P8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ift27Q9D0P8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms