Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ribc1Q9D0B8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms